Bόρεια και Ανατολικά της Πάτμου υπάρχουν πολλές νησίδες, με συνολική ακτογραμμή περίπου 65 χιλιομέτρων. Σε αυτό το εξαιρετικής ομορφιάς νησιωτικό σύμπλεγμα βρίσκουν καταφύγιο σπάνια θαλασσοπούλια – αιγαιόγλαρος, ασημόγλαρος, καστανοκέφαλος γλάρος κ.ά. –, αρπακτικά – μαυροπετρίτης, αετογερακίνα, σπιζαετός κ.ά. –, καθώς και αποδημητικά πουλιά, η μεσογειακή φώκια και η θαλάσσια χελώνα. Σημαντική είναι και η χλωρίδα, με σπάνια είδη φυτών.
Το Χιλιομόδι εξαιτίας της φυσικής και αυθεντικής του ομορφιάς έχει γίνει τα τελευταία χρόνια πόλος έλξης. Το Χιλιομόδι έγινε ένας τόπος ηρεμίας για τους επισκέπτες, ένας χώρος απόλαυσης που μπορούν να το επισκεφθούν το καλοκαίρι με ιδιωτικό σκάφος που εκτελεί δρομολόγιο από το λιμάνι της Σκάλας.
Μαράθι: Το Μαράθι (ή Μάραθος) ανήκει στο σύμπλεγμα των Αρκιών και βρίσκεται ακριβώς απέναντι από το νησί των Αρκιών. Το νησί αν και μικρό, έχει έκταση μόλις 355 στρέμματα, είναι κατοικημένο και διαθέτει έναν μικρό οικισμό και πολύ καλή παραλία.